В дисертації розроблено методи підвищення захищеності алгоритмів і програм: метод структурно-функціонального перетворення моделей алгоритмічного процесу та метод динамічних алгоритмічних перетворювачів. Розроблені методи дозволяють ускладнити аналіз алгоритму за рахунок змін його структури та функцій, а також за рахунок активізації в обфускаційному алгоритмі різних гілок при реалізації різних модифікацій моделі алгоритмічного процесу. Розроблено програмні та апаратні засоби автоматизації аналізу алгоритмічних структур.